MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pleurocapsa sp. PCC 7327 chromosome

Total Repeats: 19415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019689	AATC	2	8	9	16	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019689	ATA	2	6	31	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019689	TCT	2	6	43	48	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019689	TTAAAA	2	12	1518	1529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019689	GTT	2	6	1557	1562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019689	TA	3	6	1590	1595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019689	TCTT	2	8	1635	1642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019689	A	6	6	1761	1766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019689	ATCT	2	8	1774	1781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019689	AAACT	2	10	1886	1895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019689	AATTC	2	10	1914	1923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019689	T	7	7	1933	1939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019689	CAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019689	TCGA	2	8	2019	2026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019689	AGC	2	6	2062	2067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019689	TACC	2	8	2134	2141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019689	CAG	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019689	TAG	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019689	TCA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019689	GA	3	6	2293	2298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019689	AG	3	6	2309	2314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019689	CTT	2	6	2366	2371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019689	TA	4	8	2484	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019689	AAAG	2	8	2568	2575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019689	CTG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019689	GAT	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019689	GAT	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019689	ACT	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019689	ATTTT	2	10	6979	6988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019689	GGT	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019689	TCC	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019689	T	6	6	7130	7135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019689	CGA	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019689	TCT	2	6	10085	10090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019689	TAA	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019689	T	6	6	10231	10236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019689	A	6	6	10352	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019689	GCC	2	6	11366	11371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019689	CGG	2	6	11401	11406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019689	TTAG	2	8	11423	11430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019689	TAG	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019689	GA	3	6	11477	11482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019689	A	6	6	11501	11506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019689	CCCG	2	8	11507	11514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_019689	AGT	2	6	11518	11523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019689	A	6	6	12993	12998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019689	TTA	3	9	13020	13028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019689	CT	3	6	13100	13105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019689	CT	3	6	13940	13945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019689	ATTTA	2	10	15104	15113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019689	TTG	2	6	15127	15132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019689	A	7	7	15145	15151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019689	GAGCG	2	10	15243	15252	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019689	TCT	2	6	15269	15274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019689	CTC	2	6	15290	15295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019689	CTAG	2	8	15359	15366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019689	GA	3	6	15502	15507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019689	ATTC	2	8	15566	15573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019689	T	7	7	15626	15632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019689	GAT	2	6	15634	15639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019689	GAT	2	6	15729	15734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019689	TTTTG	2	10	15752	15761	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019689	T	6	6	15774	15779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019689	A	6	6	15785	15790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019689	CAT	2	6	16661	16666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019689	TGC	2	6	18167	18172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019689	GCC	2	6	18213	18218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019689	T	6	6	19251	19256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019689	T	6	6	19283	19288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019689	CCCG	2	8	19296	19303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_019689	GCT	2	6	19921	19926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019689	TC	3	6	19976	19981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019689	GA	3	6	20024	20029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019689	AGG	2	6	21508	21513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019689	GGC	2	6	21548	21553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019689	CGA	3	9	21569	21577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019689	CCG	2	6	21580	21585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019689	AAT	2	6	21631	21636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019689	ATC	2	6	21646	21651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019689	T	6	6	21660	21665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019689	CAA	2	6	21799	21804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019689	TGT	2	6	21809	21814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019689	TCT	2	6	21842	21847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019689	AGA	2	6	21850	21855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019689	GATTT	2	10	24956	24965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019689	T	7	7	24963	24969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019689	TAG	2	6	25013	25018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019689	T	6	6	25033	25038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019689	ATA	2	6	25056	25061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019689	TAA	2	6	25088	25093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019689	T	6	6	25099	25104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019689	GTA	2	6	25173	25178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019689	TTAG	2	8	25274	25281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019689	A	7	7	25331	25337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019689	AGAA	2	8	25445	25452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019689	GATT	2	8	25457	25464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019689	ATG	2	6	25515	25520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019689	TTC	2	6	25532	25537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019689	CTG	2	6	25598	25603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019689	AGC	2	6	25705	25710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019689	ACA	2	6	25731	25736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019689	TCCTG	2	10	25765	25774	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_019689	GGT	2	6	25776	25781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019689	GGT	2	6	25813	25818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019689	CGAT	2	8	25839	25846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019689	CGA	2	6	25873	25878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019689	AGA	2	6	27558	27563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019689	TCAA	3	12	27573	27584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019689	CAT	2	6	27585	27590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019689	TA	3	6	29419	29424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019689	CTTG	2	8	31221	31228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019689	A	7	7	31254	31260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019689	AT	3	6	31267	31272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019689	TAT	2	6	32102	32107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019689	GAAAA	2	10	32127	32136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019689	GTAA	2	8	32182	32189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019689	ACC	2	6	34958	34963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019689	TTA	2	6	34974	34979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019689	CTAA	2	8	35397	35404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019689	TCT	2	6	35458	35463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019689	AGA	2	6	35466	35471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019689	GTT	2	6	35508	35513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019689	ATG	2	6	35518	35523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019689	ATTTT	2	10	36645	36654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019689	A	7	7	36664	36670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019689	ATC	2	6	36684	36689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019689	ATAA	2	8	37559	37566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019689	TCA	2	6	39607	39612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019689	A	10	10	39614	39623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019689	TTG	2	6	41686	41691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019689	TTGCAA	4	24	41731	41754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019689	TGCT	2	8	41758	41765	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019689	TGT	2	6	41783	41788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019689	TGC	2	6	41828	41833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019689	TCG	2	6	41845	41850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019689	GCTT	2	8	41885	41892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019689	GTT	2	6	41930	41935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019689	A	6	6	42027	42032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019689	CGC	2	6	42078	42083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019689	TGCT	2	8	42427	42434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019689	AAT	2	6	42455	42460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019689	ATG	2	6	42482	42487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019689	AT	3	6	42557	42562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019689	TCA	2	6	42590	42595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019689	TG	3	6	42634	42639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019689	GCA	2	6	42643	42648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019689	AAT	2	6	42672	42677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019689	CTG	2	6	44126	44131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019689	CAA	2	6	44998	45003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019689	TTG	2	6	45004	45009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_019689	AAT	2	6	47881	47886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_019689	CTA	2	6	123705	123710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_019689	AAT	2	6	123778	123783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_019689	AGC	2	6	123810	123815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_019689	AAG	2	6	123859	123864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_019689	AGA	2	6	123894	123899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_019689	CCAA	2	8	123900	123907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
441	NC_019689	AGAA	2	8	123922	123929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_019689	AGG	2	6	123930	123935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019689	GCAA	2	8	124003	124010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_019689	AACT	2	8	124042	124049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
445	NC_019689	A	6	6	124134	124139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_019689	ATC	2	6	124239	124244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_019689	AGC	2	6	124340	124345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_019689	CTCGT	2	10	124396	124405	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
450	NC_019689	AAATC	2	10	124424	124433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
451	NC_019689	TTGG	2	8	124447	124454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019689	CAA	2	6	124463	124468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_019689	GA	4	8	124469	124476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_019689	AAT	2	6	124494	124499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_019689	AAC	2	6	124546	124551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_019689	GAA	2	6	124587	124592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_019689	GAT	2	6	124656	124661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_019689	TAA	2	6	124709	124714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_019689	GCT	2	6	124743	124748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_019689	TAA	2	6	124847	124852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_019689	TTA	2	6	124899	124904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_019689	TCAT	2	8	124915	124922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
463	NC_019689	AGT	2	6	124930	124935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_019689	CAA	2	6	125024	125029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_019689	TTG	2	6	126054	126059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_019689	CAA	2	6	126069	126074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_019689	GGA	2	6	126108	126113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
468	NC_019689	TCC	2	6	126920	126925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_019689	ATTT	2	8	129563	129570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_019689	TGG	2	6	129581	129586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_019689	TGAC	2	8	129603	129610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_019689	GTCA	2	8	129740	129747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_019689	AG	3	6	129751	129756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
475	NC_019689	AAC	2	6	129813	129818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_019689	TCGC	2	8	131892	131899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_019689	TGA	2	6	133453	133458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_019689	TTAG	2	8	133471	133478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_019689	A	6	6	133530	133535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_019689	ATT	2	6	135978	135983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_019689	T	8	8	137101	137108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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